New Larix-associated Suillus species (Boletales, Agaricomycetes) from North Asia

オカレンス（観察データと標本)
最新バージョン Yugra State University Biological Collection (YSU BC) により出版 12 15, 2024 Yugra State University Biological Collection (YSU BC)
公開日:
2024/12/15
ライセンス:
CC-BY-NC 4.0

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説明

The dataset share information for 13 specimens examined during the description of the new Suillus species from North Asia.The specimens of the Suillus bresadolae f. flavogriseus (Cazzoli & Consiglio) Klofac, Suillus nueschii var. caerulescens Singer, Suillus gastroflavus Zvyagina, Rebriev, Sazanova & E.F. Malysheva and new species are annotated. Annotations are accompanied by geographic data, images of original labels, fruiting bodies, exsicсates and microstructures.

データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、13 レコードが含まれています。

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バージョン

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引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Zvyagina E, Sazanova N (2024). New Larix-associated Suillus species (Boletales, Agaricomycetes) from North Asia. Version 1.5. Yugra State University Biological Collection (YSU BC). Occurrence dataset. http://ipt.ugrasu.ru:8080/resource?r=kovalenkoi&v=1.5

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Yugra State University Biological Collection (YSU BC)。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 5e2d1104-a25f-40ab-8a99-d8426a27b65eが割り当てられています。   Participant Node Managers Committee によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているYugra State University Biological Collection (YSU BC) が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence; Specimen

連絡先

Elena Zvyagina
  • メタデータ提供者 ●
  • 最初のデータ採集者 ●
  • 連絡先
researcher
Yugra State University
Chekhova street, 16
628012 Khanty-Mansiysk
Khanty-Mansi Autonomous Okrug-Yugra
RU
http://orcid.org/0000-0003-2063-4847
Nina Sazanova
  • メタデータ提供者 ●
  • 最初のデータ採集者
Herbarium curator of fungi
Institute of Biological Problems of the North of the Far East Branch of the Russian Academy of Sciences
Portovaja Street, 18
685000 Magadan
Magadan Region
http://orcid.org/0000-0002-0788-1942
Nina Filippova
  • キュレーター
senior researcher
Yugra State University
Stroiteley street, 2
628508 Khanty-Mansiysk
Khanty-Mansi Autonomous Okrug-Yugra
RU
https://fungariumysu.org/
http://orcid.org/0000-0002-9506-0991

地理的範囲

Specimens originated from Italia (Suillus bresadolae f. flavogriseus (Cazzoli & Consiglio) Klofac MCVE18244 Ex Herb Simonini N1844) and Russian Federation from Altay Mountains (Suillus nueschii var. caerulescens Singer LE4547, LE4554), Irkutsk Region (Suillus sp. LE18056, LE18089, LE18421, LE4766) and Magadan Region (Suillus sp. MAG5111, MAG2642, MAG1307, MAG1308, Suillus gastroflavus Zvyagina, Rebriev, Sazanova & E.F. Malysheva Holotype MAG3480 and Paratype MAG5122/LE312702)

座標（緯度経度） 南 西 [43.069, -177.188], 北 東 [73.628, 1.406]

生物分類学的範囲

13 specimens, 5 species, 1 variety, 1 form

Species Suillus gastroflavus, Ixocomus flavus
Variety Suillus nueschii var. caerulescens
Form Suillus bresadolae f. flavogriseus

時間的範囲

開始日 / 終了日 1937-08-05 / 2018-08-21

プロジェクトデータ

The new laboratory of molecular methods for biodiversity research and monitoring was organized thanks to the support of the Russian Ministry of Sience and Education grant for organization of New Young Researcher Laboratories as part of the implementation of the national project Science and Universities.

タイトル Laboratory for the development of a metagenomic analysis methodology for express assessment of environmental impacts in conditions of intensive subsoil use on the basis of Yugra State University
ファンデイング Russian Ministry of Sience and Education grant for organization of New Young Researcher Laboratories as part of the implementation of the national project Science and Universities
研究の意図、目的、背景など（デザイン） Our goal is to develop molecular methods of biodiversity inventory with the aim of environmental impact assessment in the region of intence oil and gas management. With special love for fungi and raised bogs, we intend to initiate the molecular approach to study these important and vulnеrable communities

プロジェクトに携わる要員:

Nina Filippova
  • キュレーター
http://orcid.org/0000-0002-9506-0991

収集方法

Collections were made, documented and preserved using the standard methods (Bondartsev, Zinger, 1955, Tulloss, 1999, Halling, 1996)

Study Extent The dataset contains annotations of specimens used for comparative and phylogenetic study, as well as their images and links to DNA sequences in the GenBank
Quality Control All determinations could be checked online or by the request of specimens from the LE and MAG. DNA sequences are deposited in Genbank.

Method step description:

  1. Specimens were photographed in situ, examined for taste and smell, dried at temperatures below 50°C.
  2. Macroscopic descriptions were based on the study of both fresh and dried materials as well as on photographs.
  3. Microstructures were observed at ×400 and ×1000 in squash preparations in 5% KOH, Congo Red, and Melzer’s reagent. Up to 30 basidiospores, 10 hymenial cystidia, and 10 terminal elements of the pileipellis per specimen were measured to obtain descriptive statistics.
  4. Measurements were made in ADFImageCapture calibrated by OMP object-micrometre (LOMO). Dimensions are given as (absolute min) average min–average max (absolute max) of the all examined specimens, Q = average min–average max quotient (length/width ratio).
  5. PCR ITS products were obtained without DNA extraction using the standard protocol of Thermo Scientific Phire Tissue Direct PCR Master Mix kit.
  6. For amplification of the ITS region the primers ITS1-F, ITS4-B (Gardes, Bruns, 1993) were used.
  7. LSU (28S) was amplified with LR0R, LR5 (Vilgalys, Hester, 1990) pair of primers, TEF1 with EF1-983F and EF1-1567R (Rehner, Buckley, 2005).
  8. Amplified products were sequenced using BigDyeH Terminator 3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems, Foster City, California).
  9. The sequences were assembled in CodonCode Aligner V.9.0.1 (CodonCode Corporation).

コレクションデータ

コレクション名 Komarov Botanical Institute of RAS
コレクション識別子 LE
コレクション名 Institute of the Biological Problems of the North, Far-Eastern Branch of the Russian Academy of Sciences
コレクション識別子 MAG
コレクション名 Museo di Storia Naturale di Venezia
コレクション識別子 MCVE
標本保存方法 Dried

書誌情報の引用

  1. Gardes, M., Bruns, T.D. (1993) ITS primers with enhanced specifity for Basidiomycetes: application to identification of mycorrhizae and rusts. Mol. Ecol. 2: 113–118.
  2. Vilgalys, R., Hester, M. (1990) Rapid genetic identification and mapping of enzymatically amplified ribosomal DNA from several Cryptococcus species. Journal of Bacteriology 172: 4239–4246.
  3. Rehner, S.A., Buckley, E. (2005) A Beauveria phylogeny inferred from nuclear ITS and EF1-α sequences: Evidence for cryptic diversification and links to Cordyceps teleomorphs. Mycologia 97: 84–98. http://dx.doi.org/10.3852/mycologia.97.1.84
  4. Halling, R. E. (1996) Recommendations for collecting mushrooms for scientific study. Pp. 135-141. In: Alexiades, M. N. and J. W. Sheldon (eds.), Selected Guidelines for Ethnobotanical Research: A Field Manual. The New York Botanical Garden Press, Bronx.
  5. Tulloss, R. (1999) Trial Year Notebook for the Great Smoky Mountains National Park All Taxa Biodiversity Inventory. Epigeous Macromycetes. 75 p.
  6. Bondartsev, A.S., Singer R.A. (1950) Guidelines for the collection of higher basidial fungi for their scientific study // Proceedings of the Komarov Botanical Institute Academy of Sciences of the USSR. V 2. ( 6). P. 499–572.

追加のメタデータ

代替識別子 5e2d1104-a25f-40ab-8a99-d8426a27b65e
http://ipt.ugrasu.ru:8080/resource?r=kovalenkoi